故事讲述了赛德克族人与日本人之间的抗争故事。莫那鲁道（林庆台 饰）率领一批英勇战斗士，计划利用地形优势和灵活战术给予日军先头部队重大杀伤。然而，日本方面，也并不好对付，陆军少将镰田弥彦率军队与警察组成的联合部队，准备迅速向赛德克族人发起讨伐。山地警小岛（安藤政信 饰）利用个人威望和部族矛盾成功劝说铁木瓦力斯（马志翔 饰）连同部落加入日军阵营，协助围攻莫那鲁道。后面，更是不惜使用糜烂姓炸弹对付赛德克人。眼前满山火光，莫那鲁道会有怎样的应变之策呢？最后的胜利又会属于谁呢？而马小剑、书虫欧洋，江秀秀、乐小天对此却是高兴不已，毕竟如今陈源已经高升，跟着他干，肯定好过继续留在特别异能小组的小队里，最重要的是他们基本了解陈源的为人，他们又是他的老队友兼老朋友，跟着陈源干，心里也畅快一些。
